1938-1947 Protektorát
Toto desetiletí poznamenané okupací Československa a druhou světovou válkou přineslo také mnoho zvratů ve sportovním dění a životě. V divizním ročníku 1937-1938 se Sparta s velkými potížemi zachraňovala v soutěži a teprve zlepšeným závěrem se umístila v konečném pořadí na 9. místě s 21 body. Toto se opakovalo v další sezóně 1938-1939, kdy k záchraně stačilo 10. místo a 22 bodů. O něco lepší byl ročník 1939-1940 (7. místo s 24 body), avšak sezóna 1940-1941 znamenala definitivní sestup do I. A třídy. Spolu se Spartou sestoupily ještě Čechie Karlín, Hvězda Košíře a Union Žižkov.
Sparta sice usilovala o brzký návrat do divize, ale skončila na 4. místě s 33 body. Ani v dalších letech se nedařilo - 1942 až 1943: 8. místo a 20 bodů. Sezóna 1943-1944 byla posledním „protektorátním" ročníkem soutěže a Sparta skončila pátá s 26 body. Po osvobození vlasti byly fotbalové soutěže zahájeny na podzim roku 1945 novým ročníkem I. A třídy 1945-1946, ve kterém bylo umístění na 5. místě, 27 bodů. Ještě jednou se blýsklo na lepší časy. Bylo to v soutěžním ročníku 1946-1947, kdy Spartě unikl postup do divize jen horším brankovým poměrem. Tento rozdíl činil pouhých 359 tisícin gólu. Postupujícím byl tehdy Benešovský SK.